故事发生在被天空之壁分为三区块的假面骑士Build的国际，这儿居然出现了假面骑士Ex-Aid国际的敌人崩源体。面对神秘敌人而毫无应对方法的桐生战兔，他束手无策之时一个身体半边被金属掩盖的神秘男人在他眼前登场。 面对史无前例的危机，能拯救人类的只要那群假面骑士。赶过前作的规划，前所未见的动作场面，不该有交集的英豪们总算相遇。谜团重重的故事即将解开……