炎炎夏日，为了找到所向无敌的独角仙，大雄（大原めぐみ 配音）痛哭流涕，对哆拉A梦（水田わさび 配音）软磨硬泡。无法之下，哆拉A梦和哆拉美（千秋 配音）拿出时光圈，帮大雄在500年前的新西兰寻找独角仙，谁知却意外抓到了早已灭绝的恐鸟。为了不至于让恐鸟走向灭亡，他们决定将其送往奇观之岛。奇观之岛是由未来的科学家开发的专门用来收留、维护、研讨灭绝动物的小岛，传说岛上有一只黄金独角仙，它可为当地的生物注入生命的力气。好事多磨，大雄和小伙伴们来到了这儿，而且结识了和大雄极其相像的奥秘少年达凯（野沢雅子 配音）以及仁慈的洛科洛族。与此同时，一个黑心商人图谋捉住黄金独角仙……