明朝成化年间,朝纲腐败,奸邪当道。西厂东厂为宦官把持,混淆黑白,陷害忠良,朝野表里噤若寒蝉。时有赵怀安(李连杰 饰)等流亡剑客挺身而出,接连根除东厂数名奸佞,致令阉贼惶惶不安。适值此时,风头正劲的西厂督主雨化田(陈坤 饰)出面干涉。另一方面,宫女素慧容(范晓萱 饰)怀有身孕,绝命奔逃。被雨化田的爪牙追捕途中幸得神秘侠客凌雁秋(周迅 饰)相救。二人一路曲折逃往关外,来到曾经引起过腥风血雨的龙门客栈落脚。龙门客栈一如往昔,为阴险异常之所在。雨化田手下追逐至此,与从前而至的鞑靼商队一触即发,关键时刻更有与雨化田长相极端相似的卜仓舟(陈坤 饰)与女侠客顾少棠(李宇春 饰)投宿客栈。不久,赵怀安一众也偷偷潜至龙门。