某日，小新（矢岛晶子 配音）、小葵和美伢（楢桥美纪 配音）被一群神秘人物绑架，醒来之后发现身处一间神秘的基地之内，本来，这里是名为“温泉G组”的秘密组织，意在保护关于日本来说非常宝贵的温泉。但是，横空出世的尘垢达人博士（家弓家正 配音）企图使用“地球温泉计划”将温泉G组完全击垮。