距离暗杀杀教师（二宫和也 配音）的最终期限越来越近，一向埋伏在三年E班的秘密武器也终于出动。担负极大仇视的茅野枫（山本舞香 饰）露出了躲藏已久的触角，向杀教师展开绝命袭击。恰恰借助这一事情，杀教师讲述了自己和E班从前的代课教师雪村亚久里（桐谷美玲 饰）一段永生难忘的渊源。围绕着暗杀举动是否进行，潮田渚（山田凉介 饰）、赤羽业（菅田将晖 饰）等人截然分红两派。他们一面希望令地球免于毁灭的 ，一面试图拯救杀教师的生命。与此同时，沉默已久的各国政府也开始酝酿最终的举动，而作为全部混乱的肇事者白先生（成宫宽贵 饰）亦将成为决定杀教师命运的重要存在。师生告别的时间终将到来……