铃木园子的叔叔次郎吉不甘心失利,决议再次向怪盗基德宣布挑战。这位坏脾气的大叔斥巨资制造了巨型的飞船贝尔·雪利二世号,并以镶嵌有贵重宝石“天空的贵妇人”的戒指作赌注,约请基德前来挑战,看他能否在东京到大阪的这6小时时刻内完成这项困难的使命。柯南、小兰等人理所当然也接到约请,甚至电视台的人也兴师动众前来。跟着时刻的流逝,两边的对决悄悄展开。另一方面,恐怖组织赤色暹罗猫也登上了飞船。此前不久,赤色暹罗猫突击了国立东京微生物研究所,并盗走一种丧命的病毒。 本片根据青山刚昌的同名漫画改编,是该动画的第14部剧场版。