《打黑重案组》故事发生在南边市，当地的公安局打黑重案组遭遇到一桩扎手案子。在破案过程中，重案组遭到各式各样的阻挠，案子侦破几度中止。但公安局长和乾警们不为困难所阻，不管自己和家人所遭受的苦痛，坚持查询终究查清案情，一举打掉了南边市的黑恶组织。