从前有位“光之巨人”，他负责保卫世界平和，对立巨型怪物和外星人侵略的要挟。他便是机动奥特曼。他曾在执行任务时与科学考察队员早田进建立起联络，并在使命完成后离开了地球。时至今日，人类已进入了昌盛时代，但这只不过是平和的假象...现在，世界再次需求“光之巨人”的力气。就在这时，一个新的英雄出现了，他承继了光的基因。可是他并不巨大，是一名中等身段、多愁善感的高中生，穿着金属动力制服。他的名字叫早田进次郎，是初代机动奥特曼早田进的儿子。早田进次郎克服种种困难成为新一代机动奥特曼，一个新的故事就此打开。