不久的将来，网络黑客尼奥（基奴李维斯 饰）对这个看似正常的实际世界产生了怀疑。他结识了黑客崔妮蒂（凯莉·安·摩丝 饰），并见到了黑客安排的首领墨菲斯（劳伦斯·菲什伯恩 饰）。墨菲斯告诉他，实际世界其实是由一个名叫“母体”的计算机人工智能系统控制，人们就像他们养殖的动物，没有自由和思维，而尼奥就是能够解救人类的救世主。