明朝成化年间，朝纲腐败，奸邪当道。西厂东厂为宦官操纵，混淆黑白，陷害忠良，朝野表里噤若寒蝉。时有赵怀安（李连杰 饰）等流亡剑客挺身而出，连续铲除东厂数名奸佞，致令阉贼胆战心惊。适值此时，风头正劲的西厂督主雨化田（陈坤 饰）出面干预。另一方面，宫女素慧容（范晓萱 饰）怀有身孕，绝命奔逃。被雨化田的爪牙追捕途中幸得神秘侠客凌雁秋（周迅 饰）相救。二人一路曲折逃往关外，来到曾经引起过腥风血雨的龙门客栈落脚。龙门客栈一如往昔，为阴险异常之所在。雨化田手下追逐至此，与先前而至的鞑靼商队一触即发，关键时刻更有与雨化田长相极端类似的卜仓舟（陈坤 饰）与女侠客顾少棠（李宇春 饰）投宿客栈。不久，赵怀安一众也悄悄潜至龙门。