叙述了忍者神龟与蝙蝠侠跨时空相遇，他们本都是默默看护正义的使者。然而在根除罪恶的过程中蝙蝠侠和忍者神龟产生了误解，通过一系列打架后，解除彼此的误解，共同作战，看护城市的平和以及人们的安全。