前人类和普通人类的人种战役现已到了白热化的阶段，野野村组长逝世后，吉川（北村一辉 饰）、当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）等人聚在未详总部，苦苦思索J教授的真身。谁知就在当麻刚刚澄清真相的同时，差人医院内的成年和儿童SPEC持有者遭到残忍屠戮。愤恨的当麻无法抑制体内被封印的SPEC，她狂乱暴走，继而现身御前会议。在犹大、国际（向井理 饰）、润（大岛优子 饰）的见证下，法蒂玛第三预言实现了。恐惧刺眼的蘑菇云在上空升起，成千上万的八尺乌遮天蔽日，被愿望所支配与荼毒的国际迎来了毁灭时间。