世界大都会日本东京，光天化日之下发生了性质极其恶劣的抢劫案。某个十字路口发生诡异的交通事端，科学搜寻班（ST）的各位顺藤摸瓜查清了事端的始作俑者——天才黑客镝木彻（中山裕介 饰）。可是ST的领导者赤城左门（藤原龙也 饰）面临众人对镝木的指控含糊其辞，他支开百合根友久（冈田将生 饰），单独前往镝木的居处。未久，镝木葬身火海，而赤城作为重要嫌疑人被同僚拘捕。青山翔（志田未来 饰）、结城翠（芦名星 饰）、黑崎勇治（漥田正孝 饰）、山吹才藏（三宅弘城 饰）等手下天然不会相信赤城的认罪供词，他们想方设法要查清真相，而百合根更为此故意犯罪进入拘留所，企图近距离听取赤城的心声。而就在关键时刻，赤城越狱流亡……