世界大都会日本东京,光天化日之下发生了性质极其恶劣的抢劫案。某个十字路口发生诡异的交通事端,科学搜寻班(ST)的各位顺藤摸瓜查清了事端的始作俑者——天才黑客镝木彻(中山裕介 饰)。可是ST的领导者赤城左门(藤原龙也 饰)面临众人对镝木的指控含糊其辞,他支开百合根友久(冈田将生 饰),单独前往镝木的居处。未久,镝木葬身火海,而赤城作为重要嫌疑人被同僚拘捕。青山翔(志田未来 饰)、结城翠(芦名星 饰)、黑崎勇治(漥田正孝 饰)、山吹才藏(三宅弘城 饰)等手下天然不会相信赤城的认罪供词,他们想方设法要查清真相,而百合根更为此故意犯罪进入拘留所,企图近距离听取赤城的心声。而就在关键时刻,赤城越狱流亡……