普通的中学生鹿目圆（悠木碧 配音）有一个圆满的家庭，在生活中她是个性情温柔又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和 配音）的呈现打破了小圆平静的生活，这个性情酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇呈现了，小圆在路旁边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类的言语。它告知小圆它的名字叫丘比（加藤英美里 配音），并且提出了一个特别的要求，它希望小圆可以和它签订契约成为魔法少女。