因为幼年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，默不做声，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正派开畅慎重牢靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简略的井之原真人（神奈延年 配音），老练勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”，想要利用理树的力气来完成解救世界的重任。