本季故事首要叙述了吴刚因修仙犯错，被师傅处分在广寒宫前砍伐破而重生的桂树。偌大的广寒宫，只有吴刚砍树的声响与嫦娥和玉兔相伴。三千年日月交替，吴刚与嫦娥互生情愫，两人本只愿这样在月宫平平共度，不曾想，他们的爱却遭到了玉兔的纠缠，她偷食月晶石，将嫦娥打入转生池，更将吴刚困在了桂树之下。吴刚在月宫厨娘桂姨的协助下，逃往凡界，寻觅嫦娥，并且必须在月圆之前找到嫦娥，并与之相认。