某一日，被称为“伟人”的体型格外巨大的怪物侵略了人类的世界，他们的破坏力是如此的巨大，以至于人来在极短的时间里便失去了大片的土地。为了保护最终的生计家园，人类制作起了高墙，犹如被圈养般的生活在极有限的空间中，生活在无止尽的恐惧之中，这样一过便是一百年。艾伦（梶裕贵 配音）、三笠（石川由衣 饰）和阿尼（嶋村侑 饰）是生活在高墙之后的孩子们，艾伦怨恨查询兵团日渐懒散的作风，认为伟人有朝一日一定会向人类发起更猛烈的进攻。不幸的是，艾伦的预言完成了，超大型的伟人打破了墙壁，在人类最终的净土中暴虐。灾祸往后，幸存的艾伦一行人加入了查询兵团，艾伦和三笠更是立誓要为死去的母亲报仇。