1937年，日本帝国主义的铁蹄蹂躏中原，巍巍古都南京沦陷，数万军民被丧失人道的侵略者残暴杀害。尸横遍野，血流成河，当年富贵的南京城已经成为令人不忍卒睹的人间地狱。侵略者无视国际公约，对西方国家划定的安全区也垂涎欲滴。在市中央，置身于炮火硝烟之中的圣马德伦教堂巍峨屹立，尽心竭力庇护来此避难的人们。神父不愿离去，法比（张嘉译 饰）硬撑着留下来陪同。生活在最底层的玉墨（宋佳 饰）、春池（高叶 饰）、豆蔻（张可佳 饰）等人辗转来到教堂，可即便落难如斯仍不免遭受其他同胞的鄙视和嘲讽。