继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时刻之后火星移民计划发动，人类纷繁登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并代替了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开端了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的根究心，向太空进发，人们将此称为新领域的年代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。